A modern, csontvelői őssejtkezelésnek csak minimális eséllyel lehet kockázata.
A szokásos minimális bódítási kockázat mellett nagyon ritkán elméleti szinten előfordulhat a kezelt ízület esetleges átmeneti érzékenysége, gyulladása, ami adott esetben gyulladáscsökkentővel kezelhető. Allergiás reakció szinte kizárt, hiszen a saját szervezetből vett őssejteket juttatjuk be az ízületbe.
Más egyéb mellékhatás, szövődmény nem ismert.